Contig 012598: Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show
Alignment
This contig is upended
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JMSF007G22- GGGACGCTCAGAAGACTTCTCCCTCTCCGGCCTCCGCCGGTCCCATCGCTCTCAGA
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consensus GGGACGCTCAGAAGACTTCTCCCTCTCCGGCCTCCGCCGGTCCCATCGCTCTCAGA
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JMSF007G22- CCACCACCGACCATCGTCTATCGCTCACCGCCCACCGTCCACCGTATTTAGTTTCCTCCC
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consensus CCACCACCGACCATCGTCTATCGCTCACCGCCCACCGTCCACCGTATTTAGTTTCCTCCC
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JMSF007G22- ACCGCCCACCACATCCGACAGTATCGGTCTCCGTACTCGGTGGTTCTTCCTCCTCCCTTC
rJMSF007G22+ TTC
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consensus ACCGCCCACCACATCCGACAGTATCGGTCTCCGTACTCGGTGGTTCTTCCTCCTCCCTTC
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JMSF007G22- GAACCGGGTGCGGAATTCCTCCCTCCGGTGGTTCTGCCTTCTCGCTATTCCGGTCTCCAT
rJMSF007G22+ GAACCGGGTGCGGAATTCCTCCCTCCGGTGGTTCTGCCTTCTCGCTATTCCGGTCTCCAT
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consensus GAACCGGGTGCGGAATTCCTCCCTCCGGTGGTTCTGCCTTCTCGCTATTCCGGTCTCCAT
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JMSF007G22- ACCCGGCTTCTCCGGCAGAAGGCAGTAGCGACTCCAGTTCTCCTATCTCCGTTGCTCTAG
rJMSF007G22+ ACCCGGCTTCTCCGGCAGAAGGCAGTAGCGACTCCAGTTCTCCTATCTCCGTTGCTCTAG
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consensus ACCCGGCTTCTCCGGCAGAAGGCAGTAGCGACTCCAGTTCTCCTATCTCCGTTGCTCTAG
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JMSF007G22- C
rJMSF007G22+ CAATTGGAGCAAGCCATTGAATATTTGAAACAGCTTCAACTGTATTGCGAGCTTGACAAA
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consensus CAATTGGAGCAAGCCATTGAATATTTGAAACAGCTTCAACTGTATTGCGAGCTTGACAAA
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rJMSF007G22+ TTTGAACTCACAAGGTCTTCAAGTTCTTCTTGCGTTGCTAAGGTTTGTTTTGAACTTACA
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consensus TTTGAACTCACAAGGTCTTCAAGTTCTTCTTGCGTTGCTAAGGTTTGTTTTGAACTTACA
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rJMSF007G22+ AAATTTTCATTTGTTGTTTATTTGCCGGCTAAACCGCCTGTGGGTACTGGCCCTTGTGTT
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consensus AAATTTTCATTTGTTGTTTATTTGCCGGCTAAACCGCCTGTGGGTACTGGCCCTTGTGTT
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rJMSF007G22+ TTATTTGGCTAAATCATTTGTGGGTACCGGAGGTTTATGAAAATATGCATGATTGTTTAC
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consensus TTATTTGGCTAAATCATTTGTGGGTACCGGAGGTTTATGAAAATATGCATGATTGTTTAC
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rJMSF007G22+ AAGCTGAAAGAATTGTGATGGAAGCTAAACTGCAAGCTGAAAGAATTGAGATGGACGCAA
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consensus AAGCTGAAAGAATTGTGATGGAAGCTAAACTGCAAGCTGAAAGAATTGAGATGGACGCAA
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rJMSF007G22+ TTGTGATAGAAGCTAAACTGCAAGCTGAAAGAATTGAGATGGACGCTAAACTACAAGCTG
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consensus TTGTGATAGAAGCTAAACTGCAAGCTGAAAGAATTGAGATGGACGCTAAACTACAAGCTG
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rJMSF007G22+ AAAGAATTGAGATGGACGCTAAACTACAAGCTGAAAGAACTCCAATTCAGGCTCAAATGC
rJMSF020M13+ ATTCAGGCTCAAATGC
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consensus AAAGAATTGAGATGGACGCTAAACTACAAGCTGAAAGAACTCCAATTCAGGCTCAAATGC
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rJMSF007G22+ AAGCTCAAATTGCAAGTTTGATGGATGAGTTGCGTCGCAACGGCATGCTATCCATTCCAA
rJMSF020M13+ AAGTTCAGATTGCAAGTTTGATGGATGAGTTGCGTCGCAACGACATGCTATTCACTTCAA
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consensus AAGTTCAGATTGCAAGTTTGATGGATGAGTTGCGTCGCAACGGCATGCTATTCATTTCAA
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rJMSF007G22+ GTACTCAAGCTCAACATTCGGCCAATTCAAATGATGAAAACTTAGGAGATGATTAGATTA
rJMSF020M13+ GTACTCTAGCTGAACATTTAGCTAATTCAAATGATGAAAACTTAGAAGATGATTAGATTA
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consensus GTACTCTAGCTGAACATTTGGCTAATTCAAATGATGAAAACTTAGGAGATGATTAGATTA
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rJMSF007G22+ TGTTTATTAA
rJMSF020M13+ TGTTTATTAAACAGTTAGAGACTATGCGAGTTGAGATGGAGGCTCAGATGAAAGCTAAAC
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consensus TGTTTATTAAACAGTTAGAGACTATGCGAGTTGAGATGGAGGCTCAGATGAAAGCTAAAC
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rJMSF020M13+ TACAAGTTGAAAGAACTCAAATGCAGGCTCAAATGCAAGCTCAGAAGTTCAGATTGCAAG
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consensus TACAAGTTGAAAGAACTCAAATGCAGGCTCAAATGCAAGCTCAGAAGTTCAGATTGCAAG
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rJMSF020M13+ TTTGATGGATGAGTAAAAAAACAGCGTATTTATGGCTTTGGGACTAAGTCATCCGCATTT
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consensus TTTGATGGATGAGTAAAAAAACAGCGTATTTATGGCTTTGGGACTAAGTCATCCGCATTT
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rJMSF020M13+ ATCAGCAGCGGGGATAGTTGTAGTTCATCTGCTACTTCACAACTTCATCTGCTACTTCAC
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consensus ATCAGCAGCGGGGATAGTTGTAGTTCATCTGCTACTTCACAACTTCATCTGCTACTTCAC
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rJMSF020M13+ AACTTCAACAAGAGGGAATGAAGGAGATGGTGAACAAACAGTTAGAGACTATGCGAGTTG
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consensus AACTTCAACAAGAGGGAATGAAGGAGATGGTGAACAAACAGTTAGAGACTATGCGAGTTG
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rJMSF020M13+ AGATGGAGGCTCAGATGGAAGTTAAACTACAAGTTAAAAGAACTCAAATGCAGGCTTAAA
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consensus AGATGGAGGCTCAGATGGAAGTTAAACTACAAGTTAAAAGAACTCAAATGCAGGCTTAAA
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rJMSF020M13+ TGCAGACTCAAATGCAAGTTTGATGGATGAGTTGTGTTGCAACAACATGCTATCCACTTC
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consensus TGCAGACTCAAATGCAAGTTTGATGGATGAGTTGTGTTGCAACAACATGCTATCCACTTC
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rJMSF020M13+ AAGTACTCAAGCTGAACATTCAGCTAATTCAAATGATGAAAATTTAAGAGATGATTAGAT
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consensus AAGTACTCAAGCTGAACATTCAGCTAATTCAAATGATGAAAATTTAAGAGATGATTAGAT
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rJMSF020M13+ TATGTTTATTTATATGTGGTACTGGTTCTAATGATGTAACATTATACCTACCTATACTTT
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consensus TATGTTTATTTATATGTGGTACTGGTTCTAATGATGTAACATTATACCTACCTATACTTT