Contig 012225:  Sequence
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clone5'-sequence3'-sequence
Seq.lengthcontigBestHitEvaluedescriptionlengthcontigBestHitEvaluedescription
JMFF004L05Sequence622012225 (2)emb|CDP05909.1|2e-54unnamed protein product [Coffea canephora]742012225 (2)ref|XP_009784751.1|4e-36PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase RMA3-like [Nicotiana sylvestris] ref|XP_0

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JMFF004L05-                                                     ATTGTCCAAATTATTACT
                      ____________________________________________________________
consensus                                                       ATTGTCCAAATTATTACT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004L05-           CTCTCTCTAGATTCGCCATTTATATCTCCGTCCTCCGAAGAGTCACCCGCCGGAGTTCCG
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004L05-           AGCGCCCTGATTTTTCTATACTGGTAGTTTTCTCAATTGATTTCGCGTAGCGATCTCATG
                      ____________________________________________________________
consensus             AGCGCCCTGATTTTTCTATACTGGTAGTTTTCTCAATTGATTTCGCGTAGCGATCTCATG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004L05-           GCATTTGATACTGACGGGAGTGATGGGGCTGTTTCCATTAGTAAGCAGAAAAAGAGTGAA
                      ____________________________________________________________
consensus             GCATTTGATACTGACGGGAGTGATGGGGCTGTTTCCATTAGTAAGCAGAAAAAGAGTGAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004L05-           AATTCAGCTCCAACAATGGGATTACAAAATGCTACTGGCTGTTTTGATTGCAACATATGT
                      ____________________________________________________________
consensus             AATTCAGCTCCAACAATGGGATTACAAAATGCTACTGGCTGTTTTGATTGCAACATATGT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004L05-           TTTGAGTCGGCACATGATCCTGTGGTTACACTTTGTGGCCACTTGTACTGCTGGCCTTGC
                      ____________________________________________________________
consensus             TTTGAGTCGGCACATGATCCTGTGGTTACACTTTGTGGCCACTTGTACTGCTGGCCTTGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004L05-           ATTTACAAGTGGCTCCATATCCAGGACACCTCCCTTGAATCAGAAGAGCAACCTCAGTGT
rJMFF004L05+                                                ATCAGAAGAGCAACCTCAGTGT
                      ____________________________________________________________
consensus             ATTTACAAGTGGCTCCATATCCAGGACACCTCCCTTGAATCAGAAGAGCAACCTCAGTGT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004L05-           CCTGTTTGTAAGGCTTATATCTCAAACACCTCGTTGGTCCCTCTCTATGGCCGTGGTTCA
rJMFF004L05+          CCTGTTNGTAAGGCTTATATCTCAAACACCTCGTTGGTCCCTCTCTATGGCCGTGGTTCA
                      ____________________________________________________________
consensus             CCTGTTTGTAAGGCTTATATCTCAAACACCTCGTTGGTCCCTCTCTATGGCCGTGGTTCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004L05-           TCATCATCAGACTATGAATCCAAGAAGCTTGAACTGGAGTTCTCCATACCTCAAAGGCCA
rJMFF004L05+          TCATCATCAGACTATGAATCCAAGAAGCTTGAACTGGAGTTCTCCATACCTCAAAGGCCA
                      ____________________________________________________________
consensus             TCATCATCAGACTATGAATCCAAGAAGCTTGAACTGGAGTTCTCCATACCTCAAAGGCCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004L05-           CCAGCTCTCAGCATGAACACGCCACCGCCAAATTCACGACCACATCAGCAACTTCCGCCC
rJMFF004L05+          CCAGCTCTCAGCATGAACACGCCACCGCCAAATTCACGACCACATCAGCAACTTCCGCCC
                      ____________________________________________________________
consensus             CCAGCTCTCAGCATGAACACGCCACCGCCAAATTCACGACCACATCAGCAACTTCCGCCC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004L05-           -AATGCTTTACACCAACCACCACCACTGTTCCATCACCAACAATACTTCCCTCAAGCCTT
rJMFF004L05+          AAATGCTTTACACCAACCACCACCACTGTTCCATCACCAACAATACTTCCCTCAAGCCTT
                      ____________________________________________________________
consensus             AAATGCTTTACACCAACCACCACCACTGTTCCATCACCAACAATACTTCCCTCAAGCCTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004L05-           TGGCG                                                       
rJMFF004L05+          TGGCGGCTATGCATCAATTGGACCTTCTAGCTTCGGGGGCACAGCAGTTACCAGTTTCTT
                      ____________________________________________________________
consensus             TGGCGGCTATGCATCAATTGGACCTTCTAGCTTCGGGGGCACAGCAGTTACCAGTTTCTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004L05+          CAGCCCCACTGTTGGTATGTTTGGAGAAATGTTCTTTGCAAGGATGTTCGGTAGCACTGA
                      ____________________________________________________________
consensus             CAGCCCCACTGTTGGTATGTTTGGAGAAATGTTCTTTGCAAGGATGTTCGGTAGCACTGA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004L05+          CACAACTGTATTTGCTTACCCAAGTGTCTCAGCTGCCGGTGGCCCTAGAATGAGAAGGCA
                      ____________________________________________________________
consensus             CACAACTGTATTTGCTTACCCAAGTGTCTCAGCTGCCGGTGGCCCTAGAATGAGAAGGCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004L05+          AGAAATGCAGGTGGAGAAGTCTCTTAACAGATTATCCATCTTCCTCTTATGCTGCTTAAT
                      ____________________________________________________________
consensus             AGAAATGCAGGTGGAGAAGTCTCTTAACAGATTATCCATCTTCCTCTTATGCTGCTTAAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004L05+          TCTATGCCTTCTCCTATTCTAAATTTCAATTTTGCCTTGTATAGTTGTATCAATTATGTG
                      ____________________________________________________________
consensus             TCTATGCCTTCTCCTATTCTAAATTTCAATTTTGCCTTGTATAGTTGTATCAATTATGTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004L05+          ACTGCTTCCAAACAGTCAAGGATATAGATATTAGCCAAATACTCAGCTATTCAAGACGTG
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consensus             ACTGCTTCCAAACAGTCAAGGATATAGATATTAGCCAAATACTCAGCTATTCAAGACGTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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