Contig 012173: Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show
Alignment
This contig is upended
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rJMSF047M10- AAAATACTCTCAATATGGGATTATAAAATAAAATAA
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consensus AAAATACTCTCAATATGGGATTATAAAATAAAATAA
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rJMSF047M10- AACAGTAACAGGACAATAACACTACATTACATGATATGCATGCTTAATTTCTTTCCTTTC
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consensus AACAGTAACAGGACAATAACACTACATTACATGATATGCATGCTTAATTTCTTTCCTTTC
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rJMSF047M10- TTCTTCTTCATCCTTAAACTTTTTCATCAACCTCNGTCGATCCTANCAACTCCTTTTCTT
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consensus TTCTTCTTCATCCTTAAACTTTTTCATCAACCTCNGTCGATCCTANCAACTCCTTTTCTT
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rJMSF047M10- CAACTTCAGCTTCAGCTCTAAGTTCATTGCGAGCTACTGCTTGAACCCGCTCTTTTCCTC
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consensus CAACTTCAGCTTCAGCTCTAAGTTCATTGCGAGCTACTGCTTGAACCCGCTCTTTTCCTC
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rJMSF047M10- CAGCTTTAGATGACGCATTACCATACCAAACCATGCCTACTATCGCGATACCCATTCCCA
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consensus CAGCTTTAGATGACGCATTACCATACCAAACCATGCCTACTATCGCGATACCCATTCCCA
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rJMSF047M10- ATACAACTTGTATATTCATACCCTCTTTCCCGAAGAACAAGAATCCTAAAGTCAACACAA
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consensus ATACAACTTGTATATTCATACCCTCTTTCCCGAAGAACAAGAATCCTAAAGTCAACACAA
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rJMSF047M10- GAATGGTCTTCATGTGTCCAAGCACTTGAAATGAAACTGCAGTAAATCTGCCAATGCAGA
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consensus GAATGGTCTTCATGTGTCCAAGCACTTGAAATGAAACTGCAGTAAATCTGCCAATGCAGA
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rJMSF047M10- TGAATTGGCTGAGATTCGTCCCAATTGCTATTGTACATGAAAGGACGATCAACGACACTG
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consensus TGAATTGGCTGAGATTCGTCCCAATTGCTATTGTACATGAAAGGACGATCAACGACACTG
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rJMSF047M10- CGCTTAGAGTATAGTGATAGGCACCTACACTCTTATCAGTCAACCATTTATCTGTGATCG
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consensus CGCTTAGAGTATAGTGATAGGCACCTACACTCTTATCAGTCAACCATTTATCTGTGATCG
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rJMSF047M10- GGCCCACCAACAGCAGAGATGCAGCCTGTAGTGGTGCAGTATGCCCCCAATAAATTGAAA
JMSF047M10+ AAA
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consensus GGCCCACCAACAGCAGAGATGCAGCCTGTAGTGGTGCAGTATGCCCCCAATAAATTGAAA
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rJMSF047M10- GATCCTAGTGAGTACTTCCGTTGAAGANAGTGNACATAATACTGCTGCAAAGCAGTGCTC
JMSF047M10+ GATCCTAGTGAGTACTTCCGTTGAAGAAAGTGTACATAATACTGCTGCAAAGCAGTGCTC
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consensus GATCCTAGTGAGTACTTCCGTTGAAGAAAGTGTACATAATACTGCTGCAAAGCAGTGCTC
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rJMSF047M10- NAAANNGCAATGAAGGCAGCAA
JMSF047M10+ CAAACCGCAATGAAGGCAGCAATAAATCCCTTTGCATTGACACTCACATCAGTAACTGTA
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consensus CAAACCGCAATGAAGGCAGCAATAAATCCCTTTGCATTGACACTCACATCAGTAACTGTA
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JMSF047M10+ CAGATAGCAACACCCAGGAGAACCAACAAAATGCTTAGCTTGGTGTCTCTCGAGTATCGC
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consensus CAGATAGCAACACCCAGGAGAACCAACAAAATGCTTAGCTTGGTGTCTCTCGAGTATCGC
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JMSF047M10+ ACACTATCCAGCACAACTTCCAATAAACATGAGACAGGTATCATACTCAACTTTGCAATC
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consensus ACACTATCCAGCACAACTTCCAATAAACATGAGACAGGTATCATACTCAACTTTGCAATC
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JMSF047M10+ TGATAGAATCCCACAGAGTTCCACATCAAACTCACATTCATTCCAACAATTGAGAAGTTT
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consensus TGATAGAATCCCACAGAGTTCCACATCAAACTCACATTCATTCCAACAATTGAGAAGTTT
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JMSF047M10+ GCAAATAAAACAAATTTAATGCGCTCAGACCATGGAAGATTGGAATCCTGTATGTATCCA
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consensus GCAAATAAAACAAATTTAATGCGCTCAGACCATGGAAGATTGGAATCCTGTATGTATCCA
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JMSF047M10+ AGCCTCTTAAGAATAAGAGTCATCAGTGTAGTGGTGGCAAAATGTAGACCAGTCAAGGTT
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consensus AGCCTCTTAAGAATAAGAGTCATCAGTGTAGTGGTGGCAAAATGTAGACCAGTCAAGGTT
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JMSF047M10+ GTAGCGAAGCTGAAGCCAAAATTAGCCATTAGGGCCTTATTAACAATAATAATTCCAACA
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consensus GTAGCGAAGCTGAAGCCAAAATTAGCCATTAGGGCCTTATTAACAATAATAATTCCAACA
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JMSF047M10+ GAAGTAACAATATTAAACGTCCATGCGGCTGTATCAATAATCGCCTTCTTCTCATCCTTG
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consensus GAAGTAACAATATTAAACGTCCATGCGGCTGTATCAATAATCGCCTTCTTCTCATCCTTG
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JMSF047M10+ ACGACAGCGGAAGACATTTTTCTTTACTACAAATATCAAAAATCTCTAAAATTCAGTCTT
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consensus ACGACAGCGGAAGACATTTTTCTTTACTACAAATATCAAAAATCTCTAAAATTCAGTCTT
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JMSF047M10+ CACAAAAGCTAATCCCATCTCTCAGGACCTCCAGTTAGTTACCGATTAGGAGCCAATGCC
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consensus CACAAAAGCTAATCCCATCTCTCAGGACCTCCAGTTAGTTACCGATTAGGAGCCAATGCC