Contig 011471:  Sequence
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rJMFF004J09-                                                    TTCTTAATCAATACATTT
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consensus                                                       TTCTTAATCAATACATTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004J09-          TGGAGAAAGTCTCCGGCCAACAATCACCTAGTCACCTGGTGGGGGTGGGAGGCGAATTGG
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consensus             TGGAGAAAGTCTCCGGCCAACAATCACCTAGTCACCTGGTGGGGGTGGGAGGCGAATTGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004J09-          AGAATGAGATGGTCAATGATTGGGGTGGAAACCGGCGTCCACTACCAAATTATGGCCGGT
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consensus             AGAATGAGATGGTCAATGATTGGGGTGGAAACCGGCGTCCACTACCAAATTATGGCCGGT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004J09-          CACAAACTTCGAGTCGTCACAAGCCAAGAACAACACTGCATCTGCTACATTTTTGGGCTT
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consensus             CACAAACTTCGAGTCGTCACAAGCCAAGAACAACACTGCATCTGCTACATTTTTGGGCTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004J09-          GAGAAACTCCCCATTTTTCAGCACATTAAACGGCTCGAAAACCTTGTCGATCTCCTCTTC
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consensus             GAGAAACTCCCCATTTTTCAGCACATTAAACGGCTCGAAAACCTTGTCGATCTCCTCTTC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004J09-          CGGCATGTTCATCGACGTGCACAGCAACGGCGTCGCCACCGCCGACGGCGACACGCAATT
                      ____________________________________________________________
consensus             CGGCATGTTCATCGACGTGCACAGCAACGGCGTCGCCACCGCCGACGGCGACACGCAATT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004J09-          CACCCGGATCCCATGCTTCCCCAGCCCTATGCTGGCCGACCTGACCAGCCCCAACACCGC
JMFF004J09+                                                  CCTGACCAGCCCCAACACCGC
                      ____________________________________________________________
consensus             CACCCGGATCCCATGCTTCCCCAGCCCTATGCTGGCCGACCTGACCAGCCCCAACACCGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004J09-          GTGCTTCGACATCGCGTAGTCGATCTTCAGCGCCGTCCCGAACGTCGCCGTCACGCTGGC
JMFF004J09+           GTGCTTCGACATCGCGTAGTCGATCTTCAGCGCCGTCCCGAACGTCGCCGTCACGCTGGC
                      ____________________________________________________________
consensus             GTGCTTCGACATCGCGTAGTCGATCTTCAGCGCCGTCCCGAACGTCGCCGTCACGCTGGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004J09-          GGTGCAAATCACGCAGCCCTTCACGCCGCCGTCCACCATCGCGCGCGCCGCGTGCTTCAC
JMFF004J09+           GGTGCAAATCACGCAGCCCTTCACGCCGCCGTCCACCATCGCGCGCGCCGCGTGCTTCAC
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consensus             GGTGCAAATCACGCAGCCCTTCACGCCGCCGTCCACCATCGCGCGCGCCGCGTGCTTCAC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004J09-          CATCGCCGCCGTCCCGCGCACGTTCACGGCGAAGAGGCTGTCGGACGCGTCGAGGTCGAG
JMFF004J09+           CATCGCCGCCGTCCCGCGCACGTTCACGGCGAAGAGGCTGTCGGACGCGTCGAGGTCGAG
                      ____________________________________________________________
consensus             CATCGCCGCCGTCCCGCGCACGTTCACGGCGAAGAGGCTGTCGGACGCGTCGAGGTCGAG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004J09-          GTTGAGGATGTCTTGGTCCTGGCCGGATATCACCCCCGCGCAGCACACCACGACGTGGAC
JMFF004J09+           GTTGAGGATGTCTTGGTCCTGGCCGGATATCACCCCCGCGCAGCACACCACGACGTGGAC
                      ____________________________________________________________
consensus             GTTGAGGATGTCTTGGTCCTGGCCGGATATCACCCCCGCGCAGCACACCACGACGTGGAC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004J09-          TTGGCCGTGAGCCTCGACGGTGGCTTTCACGAGGGACTCCACTTGTTGCTCGTCGCTCAC
JMFF004J09+           TTGGCCGTGAGCCTCGACGGTGGCTTTCACGAGGGACTCCACTTGTTGCTCGTCGCTCAC
                      ____________________________________________________________
consensus             TTGGCCGTGAGCCTCGACGGTGGCTTTCACGAGGGACTCCACTTGTTGCTCGTCGCTCAC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF004J09-          GTCGCACTTCACGAAGTGATGATGAGACGACGATGACCCGCCGCCACCGATTGATTC   
JMFF004J09+           GTCGCACTTCACGAAGTGATGATGAGACGACGATGACCCGCCGCCACCGATTGATTCCGC
                      ____________________________________________________________
consensus             GTCGCACTTCACGAAGTGATGATGAGACGACGATGACCCGCCGCCACCGATTGATTCCGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004J09+           CACTTCCCGCCCCTTTTCTTCTTGAATGTCGGCGATCACCACCTTGGCGCCATGCTCCGC
                      ____________________________________________________________
consensus             CACTTCCCGCCCCTTTTCTTCTTGAATGTCGGCGATCACCACCTTGGCGCCATGCTCCGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004J09+           GAAGAGGCGGGCGGTGGCCTCCCCCAAACCACTGGCTCCTCCGGTGATGATCGCAACTTT
                      ____________________________________________________________
consensus             GAAGAGGCGGGCGGTGGCCTCCCCCAAACCACTGGCTCCTCCGGTGATGATCGCAACTTT