Contig 007567:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

clone5'-sequence3'-sequence
Seq.lengthcontigBestHitEvaluedescriptionlengthcontigBestHitEvaluedescription
JMFS005D12Sequence589007567 (2)gb|KDO70871.1|2e-39hypothetical protein CISIN_1g0028083mg, partial [Citrus sinensis] gb|KDO70872.1|
JMFS005G12Sequence577007567 (2)gb|KDO70871.1|2e-39hypothetical protein CISIN_1g0028083mg, partial [Citrus sinensis] gb|KDO70872.1|

Alignment

This contig is upended


                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS005G12+                                  TCATGTTTTAACCTATTTATCAAATTTGTCTAAATGT
JMFS005D12+                      ACAGTTAAGTTCTCATGTTTTAACCTTATANTCAAATNTGTCTAAATGT
                      ____________________________________________________________
consensus                        ACAGTTAAGTTCTCATGTTTTAACCTTTTTATCAAATTTGTCTAAATGT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS005G12+           GGAAATTATCAGATTTTTTATCAGATCCCATCTGTATGATTGAGGTATGTAATACTATTT
JMFS005D12+           GGAAATTATCAGATTTTTTATCAGATCCCATCTGTATGATTGAGGTATGTAATACTATTT
                      ____________________________________________________________
consensus             GGAAATTATCAGATTTTTTATCAGATCCCATCTGTATGATTGAGGTATGTAATACTATTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS005G12+           ACCCTTTACCAAAACCTATTACAATCAACAATGACAGTAATTTGCTTATATTGATTTACT
JMFS005D12+           ACCCTTTACCAAAACCTATTACAATCAACAATGACAGTAATTTGCTTATATTGATTTACT
                      ____________________________________________________________
consensus             ACCCTTTACCAAAACCTATTACAATCAACAATGACAGTAATTTGCTTATATTGATTTACT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS005G12+           TTTCAGGACAAAATTGAGAGTAATTTGTAACGGGAAAGGCCTATTTAAGATGATTGAGGC
JMFS005D12+           TTTCAGGACAAAATTGAGAGTAATTTGTAACGGGAAAGGCCTATTTAAGATGATTGAGGC
                      ____________________________________________________________
consensus             TTTCAGGACAAAATTGAGAGTAATTTGTAACGGGAAAGGCCTATTTAAGATGATTGAGGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS005G12+           CTCACAGTTCCAAGAGTTAGCAGACTTTTGTTGATATAGGATCCCTCTTTCCGGCGGACA
JMFS005D12+           CTCACAGTTCCAAGAGTTAGCAGACTTTTGTTGATATAGGATCCCTCTTTCCGGCGGACA
                      ____________________________________________________________
consensus             CTCACAGTTCCAAGAGTTAGCAGACTTTTGTTGATATAGGATCCCTCTTTCCGGCGGACA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS005G12+           CCAGTAGTTTCAGCTCTAGAGCTTTCAGAACCCGCCAAGTCAATGAGATGCAGTTGTGAT
JMFS005D12+           CCAGTAGTTTCAGCTCTAGAGCTTTCAGAACCCGCCAAGTCAATGAGATGCAGTTGTGAT
                      ____________________________________________________________
consensus             CCAGTAGTTTCAGCTCTAGAGCTTTCAGAACCCGCCAAGTCAATGAGATGCAGTTGTGAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS005G12+           AAGCTAACAGCCTCGCCTTCAGTATTTTCACAAGGGCTACTCTCTATTGTCAGCGTAAAT
JMFS005D12+           AAGCTAACAGCCTCGCCTTCAGTATTTTCACAAGGGCTACTCTCTATTGTCAGCGTAAAT
                      ____________________________________________________________
consensus             AAGCTAACAGCCTCGCCTTCAGTATTTTCACAAGGGCTACTCTCTATTGTCAGCGTAAAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS005G12+           ATTGTGTGACTTCTGCTGCTCAGTAGATTGAAGTTTGTAGAACCAACATGCCTATGCTCA
JMFS005D12+           ATTGTGTGACTTCTGCTGCTCAGTAGATTGAAGTTTGTAGAACCAACATGCCTATGCTCA
                      ____________________________________________________________
consensus             ATTGTGTGACTTCTGCTGCTCAGTAGATTGAAGTTTGTAGAACCAACATGCCTATGCTCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS005G12+           ATTTAGTTATCTTTACATTGAATCCTATACAGAAGAACAACGAGGTCAGTCTTGGCACAA
JMFS005D12+           ATTTAGTTATCTTTACATTGAATCCTATACAGAAGAACAACGAGGTCAGTCTTGGCACAA
                      ____________________________________________________________
consensus             ATTTAGTTATCTTTACATTGAATCCTATACAGAAGAACAACGAGGTCAGTCTTGGCACAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS005G12+           CACTGAGATTGCTCCATTTTTAATAGGAGATCAGAGGTGCACTGAAGCAACCTCTGAGTG
JMFS005D12+           CACTGAGATTGCTCCATTTTTAATAGGAGATCAGAGGTGCACTGAAGCAACCTCTGAGTG
                      ____________________________________________________________
consensus             CACTGAGATTGCTCCATTTTTAATAGGAGATCAGAGGTGCACTGAAGCAACCTCTGAGTG