Contig 006318:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

clone5'-sequence3'-sequence
Seq.lengthcontigBestHitEvaluedescriptionlengthcontigBestHitEvaluedescription
JMFS004D12Sequence522006318 (8)
JMFS032F10Sequence614006318 (8)
JMFS064H12Sequence627006318 (8)
JMFS117E01Sequence627006318 (8)
JMFS117G02Sequence615006318 (8)
JMFS123G06Sequence590006318 (8)
JMFS139G05Sequence626006318 (8)
JMFS147A08Sequence642006318 (8)

Alignment

This contig is upended


. : . : . : . : . : . :
JMFS117E01+ AAGATTAATTTGTAAGTAATTTCATTAATCTTCTAATAATCTGTA
JMFS032F10+ TAATTTCATTAATCTTCTAATAATCTGTA
JMFS117G02+ TAAGTAATTTCATTAATCTTCTAATAATCTGTA
JMFS139G05+ TTTGTAAGTAATTTCATTAATCTTCTAATAATCTGTA
JMFS064H12+ TTAATTTGTAAGTAATTTCATTAATCTTCTAATAATATGTA
JMFS123G06+ TTAATTTGTAAGTAATTTCATTAATCTTCTAATAATCTGTA
JMFS147A08+ TTAATTTGTAAGTAATTTCATTAATCTTCTAATAATCTGTA
                      ____________________________________________________________
consensus AAGATTAATTTGTAAGTAATTTCATTAATCTTCTAATAATCTGTA
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS117E01+ GTTAATCTTCTGCCACTTCCTAGTTAATGTTGCTTGTTTCAACTTTCAAGTATAATAATT
JMFS004D12+ TT
JMFS032F10+ GTTAATCTTCTGCCACTTCCTAGTTAATGTTGCTTGTTTCAACTTTCAAGTATAATAATT
JMFS117G02+ GTTAATCTTCTGCCACTTCCTAGTTAATGTAGCTTGTTTCAACTCTCAAGTATAATAATT
JMFS139G05+ GTTAATCTTCTGCCACTTCCTAGTTAATGTTGCTTGTTTCAACTTTCAAGTATAATAATT
JMFS064H12+ GTTAATCTTCTGCCACTTCCTAGTTAATGTTGCTTGTTTCAACTTTCAAGTATAATAATT
JMFS123G06+ GTTAATCTTCTGCCACTTCCTAGTTAATGTTGCTTGTTTCAACTTTCAAGTATAATAATT
JMFS147A08+ GTTAATCTTCTGCCACTTCCTAGTTAATGTTGCTTGTTTCAACTTTCAAGTATAATAATT
                      ____________________________________________________________
consensus GTTAATCTTCTGCCACTTCCTAGTTAATGTTGCTTGTTTCAACTTTCAAGTATAATAATT
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS117E01+ TCTGTAGTTAATAAGTTCAAAGTATAATAATTTTGAATACTAGCTCTATTACATTGTAAC
JMFS004D12+ TCTGTAGTTAATAAGTTCAAAGTATAATAATTTTGAATACTAGCTCTATTACATTGTAAC
JMFS032F10+ TCTGTAGTTAATAAGTTCAAAGTATAATAATTTTGAATACTAGCTCTATTACATTGTAAC
JMFS117G02+ TCTGTAGTTAATAAGTTCAAAGTATAATAATTTTGAATACTAGCTCTATTACATTGTAAC
JMFS139G05+ TCTGTAGTTAATAAGTTCAAAGTATAATAATTTTGAATACTAGCTCTATTACATTGTAAC
JMFS064H12+ TCTGTAGTTAATAAGTTCAAAGTATAATAATTTTGAATACTAGCTCTATTACATTGTAAC
JMFS123G06+ TCTGTAGTTAATAAGTTCAAAGTATAATAATTTTGAATACTAGCTCTATTACATTGTAAC
JMFS147A08+ TCTGTAGTTAATAAGTTCAAAGTATAATAATTTTGAATACTAGCTCTATTACATTGTAAC
                      ____________________________________________________________
consensus TCTGTAGTTAATAAGTTCAAAGTATAATAATTTTGAATACTAGCTCTATTACATTGTAAC
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS117E01+ GCCTCCATTGAGGCTTGAACTCACAACCTTCCTAATGGAAGTCCAACCCGGGTACCATTG
JMFS004D12+ GCCTCCATTGAGGCTTGAACTCGCAACCTTCCTAATGGAAGTCTAACCCGGGTACCATTG
JMFS032F10+ GCCTCCATTGAGGCTTGAACTCACAACCTTCCTAATGGAAGTCCAACCCGGGTACCATTG
JMFS117G02+ GCCTCCATTGAGGCTTGAACTCACAACCTTCCTAATGGAAGTCCAACCCGGGTACCATTG
JMFS139G05+ GCCTCCATTGAGGCTTGAACTCACAACCTTCCTAATGGAAGTCCAACCCGGGTACCATTG
JMFS064H12+ GCCTCCATTGAGGCTTGAACTCACAACCTTCCTAATGGAAGTCCAACCCGGGTACCATTG
JMFS123G06+ GCCTCCATTGAGGCTTGAACTCACAACCTTCCTAATGGAAGTCCAACCCGGGTACCATTG
JMFS147A08+ GCCTCCATTGAGGCTTGAACTCACAACCTTCCTAATGGAAGTCCAACCCGGGTACCATTG
                      ____________________________________________________________
consensus GCCTCCATTGAGGCTTGAACTCACAACCTTCCTAATGGAAGTCCAACCCGGGTACCATTG
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS117E01+ GACCTTCCTAAAAGTTGTTTATTCAATTAAACTTACAGTACTTGAAGAAATAAACACCAA
JMFS004D12+ GACCTTCCTAAAAGTTGTTTATTCAATTAAACTTACAGTACTTGAAGAAATAAACACCAA
JMFS032F10+ GACCTTCCTAAAAGTTGTTTATTCAATTAAACTTACAGTACTTGAAGAAATAAACACCAA
JMFS117G02+ GACCTTCCTAAAAGTTGTTTATTCAATTAAACTTACAGTACTTGAAGAAATAAACACCAA
JMFS139G05+ GACCTTCCTAAAAGTTGTTTATTCAATTAAACTTACAGTACTTGAAGAAATAAACACCAA
JMFS064H12+ GACCTTCCTAAAAGTTGTTTATTCAATTAAACTTACAGTACTTGAAGAAATAAACACCAA
JMFS123G06+ GACCTTCCTAAAAGTTGTTTATTCAATTAAACTTACAGTACTTGAAGAAATAAACACCAA
JMFS147A08+ GACCTTCCTAAAAGTTGTTTATTCAATTAAACTTACAGTACTTGAAGAAATAAACACCAA
                      ____________________________________________________________
consensus GACCTTCCTAAAAGTTGTTTATTCAATTAAACTTACAGTACTTGAAGAAATAAACACCAA
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS117E01+ AATTTGATGAACTCCCCATTAAATTTTCTAAGCTGGAGGATTTGACGATTTGACGAGCCA
JMFS004D12+ AATTTGATGAACTCCCCATTAAATTTTCTAAGCTGGAGGATTTGACGATTTGACGAGCCA
JMFS032F10+ AATTTGATGAACTCCCCATTAAATTTTCTAAGCTGGAGGATTTGACGATTTGACGAGCCA
JMFS117G02+ AATTTGATGAACTCCCCATTAAATTTTCTAAGCTGGAGGATTTGACGATTTGACGAGCCA
JMFS139G05+ AATTTGATGAACTCCCCATTAAATTTTCTAAGCTGGAGGATTTGACGATTTGACGAGCCA
JMFS064H12+ AATTTGATGAACTCCCCATTAAATTTTCTAAGCTGGAGGATTTGACGATTTGACGAGCCA
JMFS123G06+ AATTTGATGAACTCCCCATTAAATTTTCTAAGCTGGAGGATTTGACGATTTGACGAGCCA
JMFS147A08+ AATTTGATGAACTCCCCATTAAATTTTCTAAGCTGGAGGATTTGACGATTTGACGAGCCA
                      ____________________________________________________________
consensus AATTTGATGAACTCCCCATTAAATTTTCTAAGCTGGAGGATTTGACGATTTGACGAGCCA
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS117E01+ TTGAGTAGCATACCGGCGGACAACGGTCACAAGTCGAAGCCTTGGAAGAGATCTAGGGTT
JMFS004D12+ TTGAGTAGCATACCGGCGGACAACGGTCACAAGTCGAAGCCTTGGAAGAGATCTAGGGTT
JMFS032F10+ TTGAGTAGCATACCGGCGGACAACGGTCACAAGTCGAAGCCTTGGAAGAGATCTAGGGTT
JMFS117G02+ TTGAGTAGCATACCGGCGGACAACGGTCACAAGTCGAAGCCTTGGAAGAGATCTAGGGTT
JMFS139G05+ TTGAGTAGCATACCGGCGGACAACGGTCACAAGTCGAAGCCTTGGAAGAGATCTAGGGTT
JMFS064H12+ TTGAGTAGCATACCGGCGGACAACGGTCACAAGTCGAAGCCTTGGAAGAGATCTAGGGTT
JMFS123G06+ TTGAGTAGCATACCGGCGGACAACGGTCACAAGTCGAAGCCTTGGAAGAGATCTAGGGTT
JMFS147A08+ TTGAGTAGCATACCGGCGGACAACGGTCACAAGTCGAAGCCTTGGAAGAGATCTAGGGTT
                      ____________________________________________________________
consensus TTGAGTAGCATACCGGCGGACAACGGTCACAAGTCGAAGCCTTGGAAGAGATCTAGGGTT
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS117E01+ TCCAGGTTGAGCAACGATTTGACGAAGGTGTAGGAGAGACTCGAGAGACGAGATGACAGA
JMFS004D12+ TCCAGGTTGAGCAACGATTTGACGAAGGTGTAGGAGAGACTCGAGAGACGAGATGACAGA
JMFS032F10+ TCCAGGTTGAGCAACGATTTGACGAAGGTGTAGGAGAGACTCGAGAGACGAGATGACAGA
JMFS117G02+ TCCAGGTTGAGCAACGATTTGACGAAGGTGTAGGAGAGACTCGAGAGACGAGATGACAGA
JMFS139G05+ TCCAGGTTGAGCAACGATTTGACGAAGGTGTAGGAGAGACTCGAGAGACGAGATGACAGA
JMFS064H12+ TCCAGGTTGAGCAACGATTTGACGAAGGTGTAGGAGAGACTCGAGAGACGAGATGACAGA
JMFS123G06+ TCCAGGTTGAGCAACGATTTGACGAAGGTGTAGGAGAGACTCGAGAGACGAGATGACAGA
JMFS147A08+ TCCAGGTTGAGCAACGATTTGACGAAGGTGTAGGAGAGACTCGAGAGACGAGATGACAGA
                      ____________________________________________________________
consensus TCCAGGTTGAGCAACGATTTGACGAAGGTGTAGGAGAGACTCGAGAGACGAGATGACAGA
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS117E01+ GCCGGAGAAGAAGTCACGGAGAGGTTGGGAAACTGCGAGAAGAGTGAGAGGCAGAGCCGT
JMFS004D12+ GCCGGAGAAGAAGTCACGGAGAGGTTGGGAACCTGCGAGAAGAGTGAGAGGCAGAGCCGT
JMFS032F10+ GCCGGAGAAGAAGTCACGGAGAGGTTGGGAAACTGCGAGAAGAGTGAGAGGCAGAGCCGT
JMFS117G02+ GCCGGAGAAGAAGTCACGGAGAGGTTGGGAAACTGCGAGAAGAGTGAGAGGCAGAGCCGT
JMFS139G05+ GCCGGAGAAGAAGTCACGGAGAGGTTGGGAAACTGCGAGAAGAGTGAGAGGCAGAGCCGT
JMFS064H12+ GCCGGAGAAGAAGTCACGGAGAGGTTGGGAAACTGCGAGAAGAGTGAGAGGCAGAGCCGT
JMFS123G06+ GCCGGAGAAGAAGTCACGGAGAGGTTGGGAAACTGCGAGAAGAGTGAGAGGCAGAGCCGT
JMFS147A08+ GCCGGAGAAGAAGTCACGGAGAGGTTGGGAAACTGCGAGAAGAGTGAGAGGCAGAGCCGT
                      ____________________________________________________________
consensus GCCGGAGAAGAAGTCACGGAGAGGTTGGGAAACTGCGAGAAGAGTGAGAGGCAGAGCCGT
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS117E01+ AGAGAGGCGGAACGGAGGCGGGGTTGAGTGGTTGAGAGATGGAGAGATTTTGTGGGGTGA
JMFS004D12+ AGAGAGGCGGAACGGAGGCGGGGTTGAGTGGTTGAGAGATGGAGAGATTTTGTGGGGTGA
JMFS032F10+ AGAGAGGCGGAACGGAGGCGGGGTTGAGTGGTTGAGAGATGGAGAGATTTTGTGGGGTGA
JMFS117G02+ AGAGAGGCGGAACGGAGGCGGGGTTGAGTGGTTGAGAGATGGAGAGATTTTGTGGGGTGA
JMFS139G05+ AGAGAGGCGGAACGGAGGCGGGGTTGAGTGGTTGAGAGATGGAGAGATTTTGTGGGGTGA
JMFS064H12+ AGAGAGGCGGAACGGAGGCGGGGTTGAGTGGTTGAGAGATGGAGAGATTTTGTGGGGTGA
JMFS123G06+ AGAGAGGCGGAACGGAGGCGGGGTTGAGTGGTTGAGAGATGGAGAGATTTTGTGGGGTGA
JMFS147A08+ AGAGAGGCGGAACGGAGGCGGGGTTGAGTGGTTGAGAGATGGAGAGATTTTGTGGGGTGA
                      ____________________________________________________________
consensus AGAGAGGCGGAACGGAGGCGGGGTTGAGTGGTTGAGAGATGGAGAGATTTTGTGGGGTGA
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS117E01+ GAATGGTAGAAAAGCTCTGAGAGAGAGAGTGAAAATTTGAGA
JMFS004D12+ GAATGGTAGAAAAGCTCTGAGAGAGAGAGTGAAAATTTGA
JMFS032F10+ GAATGGTAGAAAAGCTCTGAGAGAGAGAGTGAAAATTTGAGAGGG
JMFS117G02+ GAATGGTAGAAAAGCTCTGAGAGAGAGAGTGAAAATTTGAGA
JMFS139G05+ GAATGGTAGAAAAGCTCTGAGAGAGAGAGTGAAAATTTGAGAGGGGTGA
JMFS064H12+ GAATGGTAGAAAAGCTCTGAGAGAGAGAGTGAAAATTTGAGAGGG
JMFS123G06+ GAATGGTAG
JMFS147A08+ GAATGGTAGAAAAGCTCTGAGAGAGAGAGTGAAAATTTGAGAGGGGTGAGCGGCGGAAAC
                      ____________________________________________________________
consensus GAATGGTAGAAAAGCTCTGAGAGAGAGAGTGAAAATTTGAGAGGGGTGAGCGGCGGAAAC