Contig 005396:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

Alignment

This contig is upended


                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF018C24-                                                             TGCGCTTTG
                      ____________________________________________________________
consensus                                                                TGCGCTTTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF018C24-          ATTAATCCATATAAAAGTTGGATCTACAAAATAAATTTACAATTTATAGACAACATTTCT
                      ____________________________________________________________
consensus             ATTAATCCATATAAAAGTTGGATCTACAAAATAAATTTACAATTTATAGACAACATTTCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF018C24-          ATAACAGGATTTCCTGAAGTAAAATTATTTCAACTTTTTGTTCTCAAAAACTTGATGCTA
                      ____________________________________________________________
consensus             ATAACAGGATTTCCTGAAGTAAAATTATTTCAACTTTTTGTTCTCAAAAACTTGATGCTA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF018C24+           TGGCAAACAGAAAATTTGTCCTCAACAATACTAACTAATGTTCCCAGACAAATAATTAAT
rJMFF018C24-          TGGCAAACAGAAAATTTGTCCTCAACAATACTAACTAATGTTCCCAGACAAATAATTAAT
                      ____________________________________________________________
consensus             TGGCAAACAGAAAATTTGTCCTCAACAATACTAACTAATGTTCCCAGACAAATAATTAAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF018C24+           AGCATCAATTAATGTGAATGAAATTTCAAGATTAAGCTTGTGCAAATGTGCCTTCTTGGC
rJMFF018C24-          AGCATCAATTAATGTGAATGAAATTTCAAGATTAAGCTTGTGCAAATGTGCCTTCTTGGC
                      ____________________________________________________________
consensus             AGCATCAATTAATGTGAATGAAATTTCAAGATTAAGCTTGTGCAAATGTGCCTTCTTGGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF018C24+           TCCCCTCGGCAGTTTCCTTCCTGTATGCCCGCAGCCTCTCCTTCAACTTTTTACTCTCCT
rJMFF018C24-          TCCCCTCGGCAGTTTCCTTCCTGTATGCCCGCAGCCTCTCCTTCAACTTTTTACTCTCCT
                      ____________________________________________________________
consensus             TCCCCTCGGCAGTTTCCTTCCTGTATGCCCGCAGCCTCTCCTTCAACTTTTTACTCTCCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF018C24+           CGAAGTTTGACTTCCGCTTCACAGCTTTTTCCTGCCTAAAGCAGCGGTCAAGCTTTATCT
rJMFF018C24-          CGAAGTTTGACTTCCGCTTCACAGCTTTTTCCTGCCTAAAGCAGCGGTCAAGCTTTATCT
                      ____________________________________________________________
consensus             CGAAGTTTGACTTCCGCTTCACAGCTTTTTCCTGCCTAAAGCAGCGGTCAAGCTTTATCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF018C24+           TCAGATCAGTGCATTCGCTAAGAATTTCCCAACGGGATGGTCCAGATGACATTTCTGAAA
rJMFF018C24-          TCAGATCAGTGCATTCGCTAAGAATTTCCCAACGGGATGGTCCAGATGACATTTCTGAAA
                      ____________________________________________________________
consensus             TCAGATCAGTGCATTCGCTAAGAATTTCCCAACGGGATGGTCCAGATGACATTTCTGAAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF018C24+           CTGCTCGATGATCTCGCAATTTGTGGAGCTAATCAGCTAAAATTCCCACCCGATCCGCTG
rJMFF018C24-          CTGCTCGATGATCTCGCAATTTGTGGAGCTAATCAGCTAAAATTCCCACCCGATCCGCTG
                      ____________________________________________________________
consensus             CTGCTCGATGATCTCGCAATTTGTGGAGCTAATCAGCTAAAATTCCCACCCGATCCGCTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF018C24+           CTGCTTACAATAGTACAATACTTGACAACTTCTTGAGCTAATCCGTTGAGGATTTCTTCG
rJMFF018C24-          CTGCTTACAATAGTACAATACTTGACAACTTCTTGAGCTAATCCGTTGAGGATTTCTTCG
                      ____________________________________________________________
consensus             CTGCTTACAATAGTACAATACTTGACAACTTCTTGAGCTAATCCGTTGAGGATTTCTTCG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF018C24+           ATTAAACTCGCCAGAAGGAAGAATCGTGAGAAGAGATGCCGCTAACGCTAAGCTTTAACG
rJMFF018C24-          ATTAAACTCGCCAGAAGGAAGAATCGTGAGAAGAGATGCCGCTAACGCTAAGCTTTAACG
                      ____________________________________________________________
consensus             ATTAAACTCGCCAGAAGGAAGAATCGTGAGAAGAGATGCCGCTAACGCTAAGCTTTAACG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF018C24+           CTTTCCCTTCCTTTCCTCTCAACGGAGATGTGGCGGTGGCGGCAATGCGAAGTTGCGAAC
rJMFF018C24-          CTTTCCCTTCCTTTCCTCTCAACGGAGATGTGGCGGTGGCGGCAATGCGAAGTTGCGAAC
                      ____________________________________________________________
consensus             CTTTCCCTTCCTTTCCTCTCAACGGAGATGTGGCGGTGGCGGCAATGCGAAGTTGCGAAC