Contig 005206:  Sequence
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clone5'-sequence3'-sequence
Seq.lengthcontigBestHitEvaluedescriptionlengthcontigBestHitEvaluedescription
JMFF003L06Sequence565005206 (3)ref|XP_008783017.1|7e-37PREDICTED: uncharacterized protein LOC103702379 isoform X8 [Phoenix dactylifera
JMSF023O07Sequence539005206 (3)ref|XP_010252822.1|9e-15PREDICTED: uncharacterized protein LOC104594285 isoform X3 [Nelumbo nucifera]320012621 (3)
JMSF036F24Sequence190005206 (3)320012621 (3)

Alignment

This contig is upended


                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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consensus                                                               TGATCGGGTA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF003L06+           CTTCGATTGTTGGTATTCAGTTTCCTTCTATCACGTTTCCTTTTAACCTCGTGAAAGGTA
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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JMSF023O07+           TCNAGATAGNGGNGCTTNTGGGCGGTTTCNTTGGGGTCCNTNTTNCCTTNTTTGNGAACN
                      ____________________________________________________________
consensus             TCAAGATAGAGGAGCTTCTGGGCGGTTTCATTGGGGTCCATCTTACCTTCTTTGAGAACA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF003L06+           GCGAGGATGTCCTCGTCGGAGTGGTCGCCGGCGATCTCTTTAATGTCTTGGATCGTCTTC
JMSF023O07+           GCGNGGATGTCCTNGTNGGNGTGGTCNCCGGCGATNTCTTTAANGTCTTGGATCGTNTTC
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF003L06+           CGGAGGTTGGCCGGAATCGAAACCCTAGCACCACCACTCATGTTCGAAAACAAAAAAAAT
JMSF023O07+           CGGNGGTTGGCCGGAATCGAAACCCTAGCCCCCCCCCTCATGTTNGAAAACNAAAAAAAT
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF003L06+           TTCAAACAAAAATACAAACTGATTGGAAAAATTGTAAAATTGAGTATAAATTAGGATTTT
JMSF023O07+           TTCNAACNAAAATNCNAACTGATTGGAAAAATTGTAAAATTGNGTATAAATTAGGATTTT
                      ____________________________________________________________
consensus             TTCAAACAAAAATACAAACTGATTGGAAAAATTGTAAAATTGAGTATAAATTAGGATTTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF003L06+           TAGAGCAGGGCCTATAAATTATTAG                                   
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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JMSF023O07+           AAAAAACTAAAACTTTATCAGGAAAAAATGTTTTAAAAAAAAATTGGTTTGAGTTAACTC
JMSF036F24+           AAAAAACTAAAACTTTATCAGGAAAAAATGTTTTAAAAAAAAATTGGTTTGAGTTAACTC
                      ____________________________________________________________
consensus             AAAAAACTAAAACTTTATCAGGAAAAAATGTTTTAAAAAAAAATTGGTTTGAGTTAACTC