Contig 005059: Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show
Alignment
This contig is upended
. : . : . : . : . : . :
rJMSF020A04+ GAATTTCTTCGGTTTTTCTGCG
rJMSF038M20+ GAATTTCTTCGGTTTTTCTGCG
JMSF038M20- GTAAGTTCATTCCACTGTGAATTTCTTCGGTTTTTCTGCG
JMSF020A04- GAATTTCTTCGGTTTTTCTGCG
____________________________________________________________
consensus GTAAGTTCATTCCACTGTGAATTTCTTCGGTTTTTCTGCG
. : . : . : . : . : . :
rJMSF020A04+ ATTTTGTTTGGACCCTTCGTTGATTGTGAAGTTGTGAATTGTTTGTTTGGAACNTTGAAC
rJMSF038M20+ ATTTTGTTTGGACCCTTCGTTGATTGNGAAGTTGTGAATTGTTTGTTTGGAACNTTGAAC
JMSF038M20- ATTTTGTTTGGACCTTTCGTTGATTGTGAAGTTGTGAATTGTTTGTTTGGAACATTGAAC
JMSF020A04- ATTTTGTTTGGACCTTTCGTTGATTGTGAAGTTGTGAATTGTTTGTTTGGAACATTGAAC
____________________________________________________________
consensus ATTTTGTTTGGACCTTTCGTTGATTGTGAAGTTGTGAATTGTTTGTTTGGAACATTGAAC
. : . : . : . : . : . :
rJMSF020A04+ CNGTGGGTAGAGACTAGAGAGGGTAAAGATCNAAGGGTGTTGAGTAGATCNAGCCCTGGT
rJMSF038M20+ CGGTGGGTAGAGACTAGAGAGGGTAAAGATCNAAGGGTGTTGAGTAGATCNAGCCCTGGT
JMSF038M20- CGGTGGGTAGAGACTAGAGAGGGTAAAGATCAAAGGGTGTTGAGTAGATCAAGCCATGGT
JMSF020A04- CGGTGGGTAGAGACTAGAGAGGGTAAAGATCAAAGGGTGTTGAGTAGATCAAGCCATGGT
____________________________________________________________
consensus CGGTGGGTAGAGACTAGAGAGGGTAAAGATCAAAGGGTGTTGAGTAGATCAAGCCCTGGT
. : . : . : . : . : . :
rJMSF020A04+ CTATTAAAGAATTCTTTTTTTTTTCCTTGTGCTTTTTTGGAATGAAAAATCAAAGAGTTT
rJMSF038M20+ CTATTAAAGAATTCTTTTTTTTTTCCTTGTGCTTTTTTGGAATGAAAAATCAAAGAGTTT
JMSF038M20- CTATTAAAGAATTCTTTTTTTTTNCCTTGNGCTTTTTTGGAANGAAAAANCAAANAGTTT
JMSF020A04- CTATTAAAGAATTCTTTTTTTTTNCCTNGNGCTTTTTTGGAANGAAAAANCAAANAGTTT
____________________________________________________________
consensus CTATTAAAGAATTCTTTTTTTTTTCCTTGTGCTTTTTTGGAATGAAAAATCAAAGAGTTT
. : . : . : . : . : . :
rJMSF020A04+ GCCTACCCACAAATAAGCTAAATAGATGGGAAGGATGATGCTTTACTTTTTGAAAGATTT
rJMSF038M20+ GCCTACCCACAAATAAGCTAAATAGATGGGAAGGATGATGCTTTACTTTTTGAAAGATTT
JMSF038M20- GCCTACCCNCAAATAANCTAAATANATGGGAAGGATGATGCTTTACTTTTTGAAANATTT
JMSF020A04- GCCTACCCNCAAATAACCTAAATANATGGGAAGGATGANGCTTTACTTTTTGAAANATTT
____________________________________________________________
consensus GCCTACCCACAAATAAGCTAAATAGATGGGAAGGATGATGCTTTACTTTTTGAAAGATTT
. : . : . : . : . : . :
rJMSF020A04+ GTTTTGTTAATTTTGTTGTTGTTTTGTGTTTCTATGTTTATTGTTCTGAAAAGATTTTGG
rJMSF038M20+ GTTTTGTTAATTTTGTTGTTGTTTTGTGTTTCTATGTTTATTGTTCTGAAAAGATTTTGG
JMSF038M20- GTTTTGTTAATTTTGTTGTTGTTTTGGGTTNCNATGTTNATNGTNCTGAAAANATTTTGG
JMSF020A04- GTTTNGTNAATTTTGTTGTTGTTTTGGGTTNCNATGTTNATNGTNCNGAAAANATTTTGG
____________________________________________________________
consensus GTTTTGTTAATTTTGTTGTTGTTTTGTGTTTCTATGTTTATTGTTCTGAAAAGATTTTGG
. : . : . : . : . : . :
rJMSF020A04+ TGTAGTTTTGGATTGATTATTTCTTTAATGGTTTTTGCTTTAGTTGTTTCTGCACTAAGA
rJMSF038M20+ TGTAGTTTTGGATTGATTATTTCTTTAATGGTTTTTGCTTTAGTTGTTTCTGCACTAAGA
JMSF038M20- NGNAGTTTTGGATTGATTATTNCTTTAAGGGTTTTTGCTTTAGTTGTTNCNGCNCTAANA
JMSF020A04- NGNAGTTTTGGATTGATTATTNCTTTAAGGGTTTTTGCTTTAGTTGTTNCNGCNCTAAAA
____________________________________________________________
consensus TGTAGTTTTGGATTGATTATTTCTTTAATGGTTTTTGCTTTAGTTGTTTCTGCACTAAGA
. : . : . : . : . : . :
rJMSF020A04+ TGATAAATTCACTCTGCCTTTGACCCTTTGTGTATCAGCTTTTTCATTCTTGTTTTGATA
rJMSF038M20+ TGATAAATTCACTCTGCCTTTGACCCTTTGTGTATCAGCTTTTTCATTCTTGTTTTGATA
JMSF038M20- TGATAAATTCACNCTGCCTTTGACCCTTTGNGNANCACCTTTTNCATNCTNGTTTTGATA
JMSF020A04- TGATAAATTCNCNCNGCCTTTGACCCTTTGNGNANCACCTTTTNCATNCTNGTTTTGATA
____________________________________________________________
consensus TGATAAATTCACTCTGCCTTTGACCCTTTGTGTATCAGCTTTTTCATTCTTGTTTTGATA
. : . : . : . : . : . :
rJMSF020A04+ AGTGAGCTTTTGTGTATCAATTATGTCTAGGAGTGGTTGATTGTACAGAGATAAAAATAT
rJMSF038M20+ AGTGAGCTTTTGTGTATCAATTATGTCTAGGAGTGGTTGATTGTACAGAGATAAAAATAT
JMSF038M20- AGNGAGCTTTTGNGTANCAATTATGNCTAGGAGNGGTTGATTGTACANANATAAAAATAT
JMSF020A04- AGNGANCTTTTGNGTANCAATTATGNCTAGGAGNGGTTGATTGTACANANATAAAAANAT
____________________________________________________________
consensus AGTGAGCTTTTGTGTATCAATTATGTCTAGGAGTGGTTGATTGTACAGAGATAAAAATAT
. : . : . : . : . : . :
rJMSF020A04+ TCCTGGAAGGATTGTTTCAGTAACTAGAGATCAAGGATT
rJMSF038M20+ TCCTGGAAGGATTGTTTCAGTAACTAGAGATCAAGGATT
JMSF038M20- TCCTGGAAGGATTGTTTCAGTAACTANAGATCAAGGATT
JMSF020A04- TCCNGGAAGGATNGTTNCAGTAACTANAGATCAAGGATTTAGATCAAAGGTGTTGAATAG
____________________________________________________________
consensus TCCTGGAAGGATTGTTTCAGTAACTAGAGATCAAGGATTTAGATCAAAGGTGTTGAATAG