Contig 003841: Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show
Alignment
This contig is upended
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rJMSF042J23+ GTGATTCACGCTTCATCCTCACTACTCTGTCTCTCCGAATCAACGCTCA
JMSF042J23- GTGATTCACGCTTCATCCTCACTACTCTGTCTCTCCGAATCAACGCTCA
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consensus GTGATTCACGCTTCATCCTCACTACTCTGTCTCTCCGAATCAACGCTCA
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rJMSF042J23+ ACACTCACCTCCGACAATGGTTTTGTAGCTATGCAAGGTACGTATGTCAACAGCGAGGAG
JMSF042J23- ACACTCACCTCCGACAATGGTTTTGTAGCTATGCAAGGTACGTATGTCAACAGCGAGGAG
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consensus ACACTCACCTCCGACAATGGTTTTGTAGCTATGCAAGGTACGTATGTCAACAGCGAGGAG
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rJMSF042J23+ AGTTCTTGTCATTCAATGGTTTACTATGGCGAGGAAAATCTATATTGTATTGTCAGTGTG
JMSF042J23- AGTTCTTGTCATTCAATGGTTTACTATGGCGAGGAAAATCTATATTGTATTGTCAGTGTG
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consensus AGTTCTTGTCATTCAATGGTTTACTATGGCGAGGAAAATCTATATTGTATTGTCAGTGTG
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rJMSF042J23+ GTCAAAGATTGAAGGTACGGACATCATGGACGGATCAAAACCCTGGAAGAAGGTATTGGG
JMSF042J23- GTCAAAGATTGAAGGTACGGACATCATGGACGGATCAAAACCCTGGAAGAAGGTATTGGG
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consensus GTCAAAGATTGAAGGTACGGACATCATGGACGGATCAAAACCCTGGAAGAAGGTATTGGG
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rJMSF042J23+ ATTGTGCACATGAAAATCAAGGAGGGGTGTTGGTGGTTGTGTATTTGTGAGATGGTTTGA
JMSF042J23- ATTGTGCACATGAAAATCAAGGAGGGGTGTTGGTGGTTGTGTATTTGTGAGATGGTTTGA
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consensus ATTGTGCACATGAAAATCAAGGAGGGGTGTTGGTGGTTGTGTATTTGTGAGATGGTTTGA
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rJMSF042J23+ CCCTCTAATGTGTTCAAGATCCAAGATGATTATTCCTGGGTTGCTAAGAAGAATAAACCG
JMSF042J23- CCCTCTAATGTGTTCAAGATCCAAGATGATTATTCCTGGGTTGCTAAGAAGAATAAACCG
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consensus CCCTCTAATGTGTTCAAGATCCAAGATGATTATTCCTGGGTTGCTAAGAAGAATAAACCG
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rJMSF042J23+ GAATGAACAAGAAATTGAAGCCCTAAAAGCAAAGATTAGAGACATTGGCAGTGTTAAGGC
JMSF042J23- GAATGAACAAGAAATTGAAGCCCTAAAAGCAAAGATTAGAGACATTGGCAGTGTTAAGGC
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consensus GAATGAACAAGAAATTGAAGCCCTAAAAGCAAAGATTAGAGACATTGGCAGTGTTAAGGC
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rJMSF042J23+ ATCTAATTCCACTGTGAAAACAAAAGTAAAGTGTTTGTGTAGAGTTGTGTTTATTGTATT
JMSF042J23- ATCTAATTCCACTGTGAAAACAAAAGTAAAGTGTTTGTGTAGAGTTGTGTTTATTGTATT
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consensus ATCTAATTCCACTGTGAAAACAAAAGTAAAGTGTTTGTGTAGAGTTGTGTTTATTGTATT
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rJMSF042J23+ TGTTTTTGTAACAATGTTAGTGTTTGTTAGTTGGGAGTTCAAGGCTAATAGTGTCGGGGT
JMSF042J23- TGTTTTTGTAACAATGTTAGTGTTTGTTAGTTGGGAGTTCAAGGCTAATAGTGTCGGGGT
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consensus TGTTTTTGTAACAATGTTAGTGTTTGTTAGTTGGGAGTTCAAGGCTAATAGTGTCGGGGT
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rJMSF042J23+ TAAAAAACTTATTTTAGCTTAACTAGTGTTGGAATGTAATGGCCTATGTAGAACTACTAT
JMSF042J23- TAAAAAACTTATTTTAGCTTAA-TAGTGTTGGAATGTAATGGCCTATGTAGAACTACTAT
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consensus TAAAAAACTTATTTTAGCTTAACTAGTGTTGGAATGTAATGGCCTATGTAGAACTACTAT
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rJMSF042J23+ G
JMSF042J23- GTGAATGATCTATTGAAGAATGTTAATGAATGCTCAATTTAAGAATGGTCAAAAAAAAAA
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consensus GTGAATGATCTATTGAAGAATGTTAATGAATGCTCAATTTAAGAATGGTCAAAAAAAAAA