Contig 001496: Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show
Alignment
This contig is upended
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rJMSF050G15+ CAAAGAGAAGCTGGGGGACCGAATAACTGCCCTCC
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consensus CAAAGAGAAGCTGGGGGACCGAATAACTGCCCTCC
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rJMSF050G15+ AACAATTGGTGTCACCTTTTGGAAAGACTGATACTGCCTCAGTTCTCCATGAAGCTANTG
rJMSF050F01+ TTTGGAAAGACTGATACTGCCTCAGTTCTCCATGAAGCTATTG
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consensus AACAATTGGTGTCACCTTTTGGAAAGACTGATACTGCCTCAGTTCTCCATGAAGCTATTG
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rJMSF050G15+ AGTACATCAAGTTCCTCCATGATCAAGTCAATGTTNTGATTACTCCCTATATGAAAAACG
rJMSF050F01+ AGTACATCAAGTTCCTCCATGATCAAGTCAATGTTTTGATTACTCCCTATATGAAAAACG
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consensus AGTACATCAAGTTCCTCCATGATCAAGTCAATGTTTTGATTACTCCCTATATGAAAAACG
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rJMSF050G15+ GGTCGCCATCCGATCAGCACTCTCAACAGAATACTGAGGAGGTTTTGGNTGAAGAAGGGT
rJMSF050F01+ GGTCGCCATCCGATCAGCACTCTCAACAGAATACTGAGGAGGTTTTGGATGAAGAAGGGT
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consensus GGTCGCCATCCGATCAGCACTCTCAACAGAATACTGAGGAGGTTTTGGATGAAGAAGGGT
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rJMSF050G15+ TGTCAAAACAAGATTTAAGGAGCCAAGGGCTATGTCTAGTGCCAATGTCAAGCACATTCC
rJMSF050F01+ TGTCAAAACAAGATTTAAGGAGCCAAGGGCTATGTCTAGTGCCAATGTCAAGCACATTCC
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consensus TGTCAAAACAAGATTTAAGGAGCCAAGGGCTATGTCTAGTGCCAATGTCAAGCACATTCC
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rJMSF050G15+ CTGTGGCTGCTGAGACAACAACTGATTTCTGGACACCAACGTTTGGGGCAAATTTCAGGT
rJMSF050F01+ CTGTGGCTGCTGAGACAACAACTGATTTCTGGACACCAACGTTTGGGGCAAATTTCAGGT
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consensus CTGTGGCTGCTGAGACAACAACTGATTTCTGGACACCAACGTTTGGGGCAAATTTCAGGT
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rJMSF050G15+ AGAAACTACTGTATAGGGAAGAGATTGAATTATTGTTCGGAGAAGTTAAAAGAAGTGAGT
rJMSF050F01+ AGAAACTACTGTATAGGGAAGAGATTGAATTATTGTTCGGAGAAGTTAAAAGAAGTGAGT
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consensus AGAAACTACTGTATAGGGAAGAGATTGAATTATTGTTCGGAGAAGTTAAAAGAAGTGAGT
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rJMSF050G15+ TTTGGTGATTTCTTTAGACCTTTGGGTTTCTTAAGGAAAAAAAGGGAAGACAGGATAGCA
rJMSF050F01+ TTTGGTGATTTCTTTAGACCTTTGGGTTTCTTAAGGAAAAAAAGGGAAGACAGGATAGCA
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consensus TTTGGTGATTTCTTTAGACCTTTGGGTTTCTTAAGGAAAAAAAGGGAAGACAGGATAGCA
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rJMSF050G15+ ATGCTGGNCCATGAAGAGGCAGAAGGGCANTATGTTTTCACAAACCAAATGATGATTAAG
rJMSF050F01+ ATGCTGGGCCATGAAGAGGCAGAAGGGCATTATGTTTTCACAAACCAAATGATGATTAAG
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consensus ATGCTGGGCCATGAAGAGGCAGAAGGGCATTATGTTTTCACAAACCAAATGATGATTAAG
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rJMSF050G15+ GTTGAATTAAAGGANAACGTTGTNATNATAATGAATAATTAAGAATAATATGGAGGTTAG
rJMSF050F01+ GTTGAATTAAAGGATAACGTTGTAATAATAATGAATAATTAAGAATAATATGGAGGTTAG
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consensus GTTGAATTAAAGGATAACGTTGTAATAATAATGAATAATTAAGAATAATATGGAGGTTAG
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rJMSF050G15+ GAACAGNTGCAAATTTAGNTGATGATGATNATGAGGGNTTAGCTAGGTTATTAATATAAT
rJMSF050F01+ GAACAGGTGCAAATTTAGTTGATGATGATTATGAGGGTTTAGCTAGGTTATTAATATAAT
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consensus GAACAGGTGCAAATTTAGTTGATGATGATTATGAGGGTTTAGCTAGGTTATTAATATAAT
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rJMSF050G15+ AACTTAATTATATTAATTANCCAATCTTATTNTTNTATGTAGTGCATGTATGTGTNGTGT
rJMSF050F01+ AACTTAATTATATTAATTAACCAATGTTATTATTGTATGTAGTGCATGTATGTGTTGTGT
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consensus AACTTAATTATATTAATTAACCAATGTTATTATTGTATGTAGTGCATGTATGTGTTGTGT
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rJMSF050G15+ TG
rJMSF050F01+ TGTTGTTGGTTGAGCTCAAAGTTAGCAGATCAGATTACTTATTACAAAGCAACTTTGTCA
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consensus TGTTGTTGGTTGAGCTCAAAGTTAGCAGATCAGATTACTTATTACAAAGCAACTTTGTCA